Najnoviji spor s Crkvom Stjepan Mesić izazvao je izjavama na komemoraciji za žrtve Jasenovca. Kome je u interesu, pitaju s Kaptola, da se Crkvu proziva posljednjim bastionom ustaškog poretka?

Kaptol je pocrvenio od bijesa! I to zbog “komunističkih” uvreda. Riječi predsjednika Stjepana Mesića nakon jasenovačke komemoracije da je “bilo katoličkih svećenika koji su okrvavili ruke (u NDH) i da bi stoga bilo dobro da vrh Katoličke crkve dođe u Jasenovac zbog onih svećenika koji su bili na strani pravde i demokracije” izazvale su buru negativnih reakcija među klerom.

A ljutnja postaje još žešća kada se pribroje riječi Ivana Fumića koji je komemoraciji u Jasenovcu rekao da “vrh Katoličke crkve u velikom luku zaobilazi Jasenovac” vjerojatno zbog toga što su “ustaše imali izdašnu pomoć većeg dijela katoličkog klera, koji i danas kao posljednji bastion brani taj poredak”.
Izneseno je nekoliko vrlo teških kleveta na račun Katoličke crkve i njezina djelovanja kako u prošlosti, tako i danas, odgovorio je Mesiću i Fumiću Tiskovni ured Hrvatske biskupske konferencije. No Crkva ne želi polemizirati, kako kaže, pa se iz Tiskovnog ureda HBK citiraju riječi kardinala Josipa Bozanića, tadašnjeg predsjednika HBK, izrečene na Bleiburgu 2007., kako “ljudi koji su pripadali komunističkomu režimu, ili ostali zaslijepljeni njegovom propagandom, i koji ne žele biti oslobođeni istinom… Prozivaju Crkvu, njezine pastire i vjernike na sličan način na koji su to činili i u ono doba”.

No prema nekim mišljenjima u Crkvi, Bozanićev je govor stara rana u Mesićevoj memoriji, zbog koje lani nije htio doći na misu za domovinu, a oduška si je dao tek sada, godinu dana nakon što su te riječi izgovorene.

“Na svu sreću istinu o djelovanju Katoličke crkve u Hrvatskoj u vrijeme Drugoga svjetskog rata više ne ‘propisuju’  državne vlasti i ideološke strukture, nego je ona predmet slobodnoga znanstvenog istraživanja.